28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0595 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0595  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  532  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1194  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.06 
 
 
257 aa  342  4e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0108631  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1188  phospholipid/glycerol acyltransferase  63.86 
 
 
253 aa  340  1e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1013  phospholipid/glycerol acyltransferase  61.85 
 
 
257 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1188  phospholipid/glycerol acyltransferase  60.24 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1369  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.09 
 
 
255 aa  305  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1111  phospholipid/glycerol acyltransferase  55.38 
 
 
260 aa  301  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2705  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.86 
 
 
286 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1971  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.17 
 
 
285 aa  118  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0688  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.57 
 
 
257 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0152  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.78 
 
 
268 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0265532  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2739  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.83 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3435  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.46 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.25815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3631  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.03 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0186268  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3744  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.98 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3157  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.97 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3620  hypothetical protein  27.81 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5030  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.06 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107709  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1599  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.27 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2706  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.7 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0764625  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2597  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.88 
 
 
233 aa  45.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100958  normal  0.0920195 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14731  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.39 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.466718  normal  0.946423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2495  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.47 
 
 
203 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000218384  hitchhiker  0.00272864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3128  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.75 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.520378  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0641  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.39 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2308  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.12 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2141  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.59 
 
 
309 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1490  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.35 
 
 
228 aa  42.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000499778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>