24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1245 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1245  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 353 aa  708    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0781  HEAT repeat-containing PBS lyase  75.07 
 
 		 353 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2420  HEAT domain containing protein  47.97 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3177  heat domain-containing protein  36.92 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  34.81 
 
 		 1148 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.53 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  30.67 
 
 		 1328 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.04 
 
 		 1343 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.57 
 
 		 192 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1094 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.72 
 
 		 180 aa  49.7  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.24 
 
 		 1438 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.39 
 
 		 524 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1224 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.25 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  35.51 
 
 		 838 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  33.58 
 
 		 959 aa  46.2  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.26 
 
 		 173 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  31.85 
 
 		 644 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.9 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02430  regulation of translational elongation-related protein, putative  30.5 
 
 		 2611 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3712  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.34 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13018  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2742  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.71 
 
 		 121 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  33.7 
 
 		 958 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>