17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1703 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1703  bacteriophage-like signal peptide protein  100 
 
 		 181 aa  351  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal  0.138015 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1135  lysis protein  41.33 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.308326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1220  phage protein, putative  32.96 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370127  hitchhiker  0.0000602761 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2181  bacteriophage lysis protein  33.82 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.225505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4582  hypothetical protein  33.88 
 
 		 165 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000093288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1184  bacteriophage lysis protein  30.1 
 
 		 155 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00247125  hitchhiker  0.0000000000330558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3523  bacteriophage lysis protein  30.84 
 
 		 154 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.328283  hitchhiker  0.000434351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5064  bacteriophage lysis protein  39.29 
 
 		 161 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0692  bacteriophage lysis protein  39.29 
 
 		 161 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1921  hypothetical protein  47.37 
 
 		 266 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.441129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  31.54 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1173  bacteriophage signal peptide protein  34.93 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  30.16 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1777  bacteriophage lysis protein  32.08 
 
 		 155 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.0335187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1614  bacteriophage lysis protein  28.68 
 
 		 153 aa  41.2  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  31.13 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  31.13 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0122029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>