36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0692 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0692  bacteriophage lysis protein  100 
 
 
161 aa  313  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5064  bacteriophage lysis protein  100 
 
 
161 aa  313  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2181  bacteriophage lysis protein  31.51 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.225505 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  34.36 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  34.36 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0122029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2251  bacteriophage lysis protein  36.59 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000357179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3140  bacteriophage lysis protein  36.59 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000519306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  32.12 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1273  bacteriophage lysis protein  34.71 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0942  bacteriophage lysis protein  41.57 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1184  bacteriophage lysis protein  35.29 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00247125  hitchhiker  0.0000000000330558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  35.1 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1172  bacteriophage lysis protein  40.45 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.583234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3523  bacteriophage lysis protein  40.7 
 
 
154 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.328283  hitchhiker  0.000434351 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00729  hypothetical protein  33.76 
 
 
153 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0229368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10031  cell lysis protein  33.76 
 
 
153 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.025296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1777  bacteriophage lysis protein  33.33 
 
 
155 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.0335187 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1403  bacteriophage lysis protein  38.89 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000130995 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2783  bacteriophage lysis protein  37.08 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1066  bacteriophage lysis protein  38.89 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00514  hypothetical protein  31.79 
 
 
153 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00508  predicted murein endopeptidase  31.79 
 
 
153 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3073  Phosphoprotein phosphatase  40.7 
 
 
153 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0893  bacteriophage lysis protein  31.17 
 
 
155 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01348  hypothetical protein  40.7 
 
 
99 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.512118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1614  bacteriophage lysis protein  31.85 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01338  predicted defective peptidase  40.7 
 
 
99 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.604576  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1138  bacteriophage lysis protein  37.78 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2899  bacteriophage lysis protein  33.77 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000634964 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1451  bacteriophage lysis protein  37.5 
 
 
99 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0305  bacteriophage lysis protein  37.5 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0828  bacteriophage lysis protein  29.66 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2247  bacteriophage lysis protein  26.14 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.727629  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01976  hypothetical protein  32.94 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2608  bacteriophage lysis protein  28.48 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.048327  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1744  lysis protein  34.44 
 
 
149 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000121347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>