40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1859 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  100 
 
 
155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  100 
 
 
155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0122029 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0942  bacteriophage lysis protein  95.48 
 
 
155 aa  297  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1172  bacteriophage lysis protein  93.51 
 
 
155 aa  293  8e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.583234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3140  bacteriophage lysis protein  94.19 
 
 
155 aa  291  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000519306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2251  bacteriophage lysis protein  94.19 
 
 
155 aa  291  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000357179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2783  bacteriophage lysis protein  88.31 
 
 
155 aa  278  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1273  bacteriophage lysis protein  87.74 
 
 
157 aa  276  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3523  bacteriophage lysis protein  87.58 
 
 
154 aa  268  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.328283  hitchhiker  0.000434351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1777  bacteriophage lysis protein  86.36 
 
 
155 aa  268  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.0335187 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1184  bacteriophage lysis protein  73.38 
 
 
155 aa  231  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00247125  hitchhiker  0.0000000000330558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  75.48 
 
 
155 aa  229  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10031  cell lysis protein  72.9 
 
 
153 aa  216  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.025296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00729  hypothetical protein  72.9 
 
 
153 aa  216  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0229368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00508  predicted murein endopeptidase  72.26 
 
 
153 aa  214  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00514  hypothetical protein  72.26 
 
 
153 aa  214  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1614  bacteriophage lysis protein  69.28 
 
 
153 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3073  Phosphoprotein phosphatase  69.28 
 
 
153 aa  209  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1138  bacteriophage lysis protein  62.99 
 
 
164 aa  196  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1403  bacteriophage lysis protein  64.19 
 
 
166 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000130995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1066  bacteriophage lysis protein  64.19 
 
 
159 aa  183  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2608  bacteriophage lysis protein  55.63 
 
 
153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.048327  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01348  hypothetical protein  74 
 
 
99 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.512118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01338  predicted defective peptidase  74 
 
 
99 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.604576  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  53.38 
 
 
145 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2899  bacteriophage lysis protein  51.28 
 
 
145 aa  138  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000634964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0828  bacteriophage lysis protein  50.64 
 
 
145 aa  136  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0305  bacteriophage lysis protein  52.94 
 
 
145 aa  131  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2247  bacteriophage lysis protein  45.39 
 
 
155 aa  124  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.727629  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0893  bacteriophage lysis protein  46.5 
 
 
155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0632  bacteriophage lysis protein  46.62 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000814148  normal  0.106962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1152  bacteriophage lysis protein  44.76 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142023  hitchhiker  0.0000000000000115024 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2818  bacteriophage lysis protein  46 
 
 
150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.570005  normal  0.122766 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2181  bacteriophage lysis protein  42.57 
 
 
152 aa  107  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.225505 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1451  bacteriophage lysis protein  52.48 
 
 
99 aa  100  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01976  hypothetical protein  38.68 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5064  bacteriophage lysis protein  34.36 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0692  bacteriophage lysis protein  34.36 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01347  hypothetical protein  50 
 
 
36 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459034  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1744  lysis protein  30.13 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000121347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>