40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0395 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  100 
 
 
145 aa  294  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2899  bacteriophage lysis protein  93.79 
 
 
145 aa  277  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000634964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0828  bacteriophage lysis protein  91.03 
 
 
145 aa  272  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0305  bacteriophage lysis protein  95.86 
 
 
145 aa  262  8.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1451  bacteriophage lysis protein  93.94 
 
 
99 aa  191  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1184  bacteriophage lysis protein  58.06 
 
 
155 aa  175  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00247125  hitchhiker  0.0000000000330558 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10031  cell lysis protein  58.55 
 
 
153 aa  166  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.025296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00729  hypothetical protein  58.55 
 
 
153 aa  166  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0229368  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1614  bacteriophage lysis protein  57.24 
 
 
153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00508  predicted murein endopeptidase  56.58 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00514  hypothetical protein  56.58 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0893  bacteriophage lysis protein  54.49 
 
 
155 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2608  bacteriophage lysis protein  50.33 
 
 
153 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.048327  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1273  bacteriophage lysis protein  52.32 
 
 
157 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3073  Phosphoprotein phosphatase  57.89 
 
 
153 aa  141  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  53.38 
 
 
155 aa  141  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0122029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  53.38 
 
 
155 aa  141  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1172  bacteriophage lysis protein  48.08 
 
 
155 aa  139  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.583234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2783  bacteriophage lysis protein  48.72 
 
 
155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0942  bacteriophage lysis protein  52.7 
 
 
155 aa  138  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3140  bacteriophage lysis protein  49.67 
 
 
155 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000519306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2251  bacteriophage lysis protein  49.67 
 
 
155 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000357179 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1138  bacteriophage lysis protein  46.1 
 
 
164 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  47.77 
 
 
155 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1777  bacteriophage lysis protein  48.34 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.0335187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3523  bacteriophage lysis protein  45.16 
 
 
154 aa  130  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.328283  hitchhiker  0.000434351 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1403  bacteriophage lysis protein  48 
 
 
166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000130995 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2247  bacteriophage lysis protein  46.79 
 
 
155 aa  127  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.727629  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1066  bacteriophage lysis protein  47.97 
 
 
159 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0632  bacteriophage lysis protein  47.37 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000814148  normal  0.106962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1152  bacteriophage lysis protein  41.55 
 
 
143 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142023  hitchhiker  0.0000000000000115024 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01348  hypothetical protein  52.04 
 
 
99 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.512118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01338  predicted defective peptidase  52.04 
 
 
99 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.604576  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2818  bacteriophage lysis protein  42 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.570005  normal  0.122766 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2181  bacteriophage lysis protein  40.67 
 
 
152 aa  87.8  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.225505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01976  hypothetical protein  41.76 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01347  hypothetical protein  93.33 
 
 
36 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5064  bacteriophage lysis protein  33.78 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0692  bacteriophage lysis protein  33.78 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1744  lysis protein  30.41 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000121347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>