39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1184 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1184  bacteriophage lysis protein  100 
 
 		 155 aa  315  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00247125  hitchhiker  0.0000000000330558 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1273  bacteriophage lysis protein  79.31 
 
 		 157 aa  233  8e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1172  bacteriophage lysis protein  73.08 
 
 		 155 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.583234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10031  cell lysis protein  75.82 
 
 		 153 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.025296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00729  hypothetical protein  75.82 
 
 		 153 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0229368  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  73.38 
 
 		 155 aa  231  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  73.38 
 
 		 155 aa  231  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0122029 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00508  predicted murein endopeptidase  75.16 
 
 		 153 aa  230  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00514  hypothetical protein  75.16 
 
 		 153 aa  230  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3140  bacteriophage lysis protein  73.38 
 
 		 155 aa  229  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000519306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2251  bacteriophage lysis protein  73.38 
 
 		 155 aa  229  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000357179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1614  bacteriophage lysis protein  73.2 
 
 		 153 aa  226  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0942  bacteriophage lysis protein  72.08 
 
 		 155 aa  226  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3523  bacteriophage lysis protein  70.97 
 
 		 154 aa  223  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.328283  hitchhiker  0.000434351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2783  bacteriophage lysis protein  69.23 
 
 		 155 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1777  bacteriophage lysis protein  69.48 
 
 		 155 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.0335187 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3073  Phosphoprotein phosphatase  73.86 
 
 		 153 aa  204  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1138  bacteriophage lysis protein  59.09 
 
 		 164 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0828  bacteriophage lysis protein  60 
 
 		 145 aa  177  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  58.71 
 
 		 155 aa  177  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1066  bacteriophage lysis protein  61.49 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1403  bacteriophage lysis protein  61.49 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000130995 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2899  bacteriophage lysis protein  58.71 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000634964 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  58.06 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2608  bacteriophage lysis protein  54.84 
 
 		 153 aa  173  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.048327  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0893  bacteriophage lysis protein  57.05 
 
 		 155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0305  bacteriophage lysis protein  58.71 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01348  hypothetical protein  73.74 
 
 		 99 aa  146  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.512118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01338  predicted defective peptidase  73.74 
 
 		 99 aa  146  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.604576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2247  bacteriophage lysis protein  46.15 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.727629  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1152  bacteriophage lysis protein  44.06 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142023  hitchhiker  0.0000000000000115024 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0632  bacteriophage lysis protein  44.67 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000814148  normal  0.106962 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2181  bacteriophage lysis protein  42.76 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.225505 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2818  bacteriophage lysis protein  45.21 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.570005  normal  0.122766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1451  bacteriophage lysis protein  52.94 
 
 		 99 aa  103  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01976  hypothetical protein  32.69 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01347  hypothetical protein  86.11 
 
 		 36 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5064  bacteriophage lysis protein  35.29 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0692  bacteriophage lysis protein  35.29 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>