39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2181 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2181  bacteriophage lysis protein  100 
 
 
152 aa  303  6e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.225505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1184  bacteriophage lysis protein  42.76 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00247125  hitchhiker  0.0000000000330558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  42.57 
 
 
155 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0122029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  42.57 
 
 
155 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1138  bacteriophage lysis protein  45.58 
 
 
164 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1273  bacteriophage lysis protein  40.38 
 
 
157 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0942  bacteriophage lysis protein  41.89 
 
 
155 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3523  bacteriophage lysis protein  42.18 
 
 
154 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.328283  hitchhiker  0.000434351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1172  bacteriophage lysis protein  40.14 
 
 
155 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.583234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3140  bacteriophage lysis protein  40.71 
 
 
155 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000519306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2251  bacteriophage lysis protein  40.71 
 
 
155 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000357179 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1403  bacteriophage lysis protein  42.47 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000130995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10031  cell lysis protein  40 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.025296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00729  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0229368  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1066  bacteriophage lysis protein  42.47 
 
 
159 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01338  predicted defective peptidase  50.53 
 
 
99 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.604576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01348  hypothetical protein  50.53 
 
 
99 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.512118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1614  bacteriophage lysis protein  40 
 
 
153 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00508  predicted murein endopeptidase  39.33 
 
 
153 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00514  hypothetical protein  39.33 
 
 
153 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2783  bacteriophage lysis protein  39.33 
 
 
155 aa  92  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3073  Phosphoprotein phosphatase  41.43 
 
 
153 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1777  bacteriophage lysis protein  39.16 
 
 
155 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.0335187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  40.67 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2608  bacteriophage lysis protein  39.87 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.048327  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2899  bacteriophage lysis protein  40.67 
 
 
145 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000634964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0828  bacteriophage lysis protein  39.33 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0305  bacteriophage lysis protein  42.45 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  35.71 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1451  bacteriophage lysis protein  45.1 
 
 
99 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2247  bacteriophage lysis protein  30.52 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.727629  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5064  bacteriophage lysis protein  31.29 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0692  bacteriophage lysis protein  31.29 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0893  bacteriophage lysis protein  33.77 
 
 
155 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1152  bacteriophage lysis protein  32.19 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142023  hitchhiker  0.0000000000000115024 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01976  hypothetical protein  32.08 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0632  bacteriophage lysis protein  33.09 
 
 
156 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000814148  normal  0.106962 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1219  phage exported protein  46.43 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2818  bacteriophage lysis protein  34.07 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.570005  normal  0.122766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>