37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0305 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0305  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0160  hypothetical protein  75.62 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0167  hypothetical protein  74.1 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0079  hypothetical protein  43.35 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0109  hypothetical protein  47.85 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0364  hypothetical protein  38.78 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.690644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0075  hypothetical protein  40.61 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.186857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3212  hypothetical protein  40.61 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1351  hypothetical protein  40.61 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.114694  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0243  hypothetical protein  40.61 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.857236  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0485  hypothetical protein  40.86 
 
 		 273 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0199  hypothetical protein  39.06 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4232  hypothetical protein  41.71 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0604  hypothetical protein  37.7 
 
 		 269 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0440  hypothetical protein  37.7 
 
 		 263 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.334931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0421  hypothetical protein  38.54 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0748675  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0394  hypothetical protein  42.2 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.672382  decreased coverage  0.00485022 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4933  hypothetical protein  34.21 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0621  hypothetical protein  34.5 
 
 		 234 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3888  hypothetical protein  38.5 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.835843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3161  hypothetical protein  39.56 
 
 		 331 aa  86.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0263  hypothetical protein  45.45 
 
 		 154 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0305  hypothetical protein  36.46 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0449  hypothetical protein  32.45 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2822  hypothetical protein  46.67 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.389795 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2959  hypothetical protein  46.67 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6253  hypothetical protein  54.29 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3635  hypothetical protein  34.05 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00166096  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3357  hypothetical protein  45.33 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2925  hypothetical protein  65.96 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2910  hypothetical protein  65.96 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294767  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2296  hypothetical protein  65.96 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4509  hypothetical protein  37.43 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0749  hypothetical protein  42.55 
 
 		 238 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3262  hypothetical protein  33.52 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.340682 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1690  conserved hypothetical membrane associated protein  40.78 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0526  hypothetical protein  39.02 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  hitchhiker  0.00000832605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>