36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3635 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3635  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00166096  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3262  hypothetical protein  57.78 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.340682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0449  hypothetical protein  45.04 
 
 
314 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0305  hypothetical protein  43.15 
 
 
329 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0621  hypothetical protein  44.5 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4933  hypothetical protein  49.72 
 
 
256 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4509  hypothetical protein  43.78 
 
 
314 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.381857 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3888  hypothetical protein  42.08 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.835843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3161  hypothetical protein  42.08 
 
 
331 aa  138  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0749  hypothetical protein  42.55 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0526  hypothetical protein  61.11 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  hitchhiker  0.00000832605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0364  hypothetical protein  38.3 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.690644  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0199  hypothetical protein  32.5 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0160  hypothetical protein  45.35 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0394  hypothetical protein  34.69 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.672382  decreased coverage  0.00485022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0109  hypothetical protein  40 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0167  hypothetical protein  45.35 
 
 
295 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0421  hypothetical protein  35.71 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0748675  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1351  hypothetical protein  37.23 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.114694  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3212  hypothetical protein  37.23 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0075  hypothetical protein  37.23 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.186857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0243  hypothetical protein  37.23 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.857236  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0440  hypothetical protein  36.43 
 
 
263 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.334931  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3357  hypothetical protein  41.33 
 
 
143 aa  62.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0604  hypothetical protein  36.43 
 
 
269 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0263  hypothetical protein  40.28 
 
 
154 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0485  hypothetical protein  50.85 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4232  hypothetical protein  50.85 
 
 
271 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0305  hypothetical protein  41.86 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2822  hypothetical protein  51.79 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.389795 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2959  hypothetical protein  51.79 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6253  hypothetical protein  51.79 
 
 
252 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0079  hypothetical protein  35.29 
 
 
299 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2925  hypothetical protein  61.36 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2296  hypothetical protein  61.36 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2910  hypothetical protein  61.36 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>