33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3262 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3262  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  554  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.340682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3635  hypothetical protein  53.37 
 
 		 249 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00166096  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0449  hypothetical protein  42.86 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4933  hypothetical protein  47.64 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0621  hypothetical protein  43.4 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0305  hypothetical protein  41.6 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4509  hypothetical protein  42.68 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381857 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3888  hypothetical protein  44.2 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.835843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3161  hypothetical protein  43.05 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0749  hypothetical protein  48.39 
 
 		 238 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0526  hypothetical protein  60.64 
 
 		 318 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  hitchhiker  0.00000832605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0199  hypothetical protein  35.59 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0263  hypothetical protein  44.44 
 
 		 154 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0364  hypothetical protein  36.9 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.690644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3357  hypothetical protein  43.06 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0421  hypothetical protein  36.26 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0748675  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0079  hypothetical protein  34.1 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0394  hypothetical protein  38.31 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.672382  decreased coverage  0.00485022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0109  hypothetical protein  36.78 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0075  hypothetical protein  37.28 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.186857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3212  hypothetical protein  37.28 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1351  hypothetical protein  37.28 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.114694  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0243  hypothetical protein  37.28 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.857236  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0160  hypothetical protein  40 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0604  hypothetical protein  37.28 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0440  hypothetical protein  38.36 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.334931  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0167  hypothetical protein  40 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0485  hypothetical protein  45.76 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4232  hypothetical protein  45.76 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0305  hypothetical protein  40.24 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2959  hypothetical protein  49.12 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2822  hypothetical protein  49.12 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.389795 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6253  hypothetical protein  49.12 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.443182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>