37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0263 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0263  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  308  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3357  hypothetical protein  55.17 
 
 
143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0199  hypothetical protein  39.84 
 
 
247 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0109  hypothetical protein  44.68 
 
 
285 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0079  hypothetical protein  44.57 
 
 
299 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0305  hypothetical protein  50.7 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0485  hypothetical protein  51.39 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0160  hypothetical protein  42.71 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0167  hypothetical protein  40.62 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0364  hypothetical protein  38.02 
 
 
279 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.690644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4232  hypothetical protein  52.94 
 
 
271 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0075  hypothetical protein  37.61 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.186857  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0394  hypothetical protein  37.12 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.672382  decreased coverage  0.00485022 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3212  hypothetical protein  37.61 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0421  hypothetical protein  37.61 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0748675  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1351  hypothetical protein  37.61 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.114694  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0243  hypothetical protein  37.61 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.857236  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0604  hypothetical protein  37.61 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0440  hypothetical protein  37.61 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.334931  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6253  hypothetical protein  49.23 
 
 
252 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2822  hypothetical protein  49.23 
 
 
249 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.389795 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2959  hypothetical protein  49.23 
 
 
249 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2296  hypothetical protein  50.91 
 
 
245 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2910  hypothetical protein  50.91 
 
 
245 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2925  hypothetical protein  50.91 
 
 
245 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3262  hypothetical protein  41.11 
 
 
291 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.340682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4933  hypothetical protein  42.31 
 
 
256 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3888  hypothetical protein  38.82 
 
 
323 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.835843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3161  hypothetical protein  39.29 
 
 
331 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0305  hypothetical protein  39.36 
 
 
329 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0621  hypothetical protein  25.85 
 
 
234 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3635  hypothetical protein  40.28 
 
 
249 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00166096  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0526  hypothetical protein  50.91 
 
 
318 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  hitchhiker  0.00000832605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0449  hypothetical protein  49.02 
 
 
314 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4509  hypothetical protein  34.48 
 
 
314 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.381857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0749  hypothetical protein  43.86 
 
 
238 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1690  conserved hypothetical membrane associated protein  46.97 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>