36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0621 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0621  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0449  hypothetical protein  52.69 
 
 		 314 aa  231  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0305  hypothetical protein  51.93 
 
 		 329 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4933  hypothetical protein  56.83 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4509  hypothetical protein  45.9 
 
 		 314 aa  191  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381857 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3888  hypothetical protein  50.24 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.835843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3161  hypothetical protein  50.72 
 
 		 331 aa  185  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3635  hypothetical protein  41.86 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00166096  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0749  hypothetical protein  48.72 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3262  hypothetical protein  44.57 
 
 		 291 aa  142  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.340682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0526  hypothetical protein  64.29 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  hitchhiker  0.00000832605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0364  hypothetical protein  31.98 
 
 		 279 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.690644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0075  hypothetical protein  33.68 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.186857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3212  hypothetical protein  33.68 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1351  hypothetical protein  33.68 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.114694  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0243  hypothetical protein  33.68 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.857236  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0199  hypothetical protein  32.51 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0421  hypothetical protein  33.16 
 
 		 265 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0748675  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0440  hypothetical protein  34.2 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.334931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0604  hypothetical protein  34.2 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0394  hypothetical protein  35.09 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.672382  decreased coverage  0.00485022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0160  hypothetical protein  37.62 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0109  hypothetical protein  38.39 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0167  hypothetical protein  38.61 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0079  hypothetical protein  29.78 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6253  hypothetical protein  49.23 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0485  hypothetical protein  50 
 
 		 273 aa  62  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2959  hypothetical protein  42.47 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4232  hypothetical protein  50 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2822  hypothetical protein  50 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.389795 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0305  hypothetical protein  32.95 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0263  hypothetical protein  36 
 
 		 154 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2925  hypothetical protein  61.36 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2296  hypothetical protein  61.36 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2910  hypothetical protein  61.36 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294767  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3357  hypothetical protein  35.53 
 
 		 143 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>