37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0079 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0079  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0109  hypothetical protein  51.52 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0160  hypothetical protein  68.57 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0305  hypothetical protein  65.09 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0167  hypothetical protein  67.62 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0364  hypothetical protein  40.21 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.690644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4232  hypothetical protein  36.76 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0075  hypothetical protein  38.59 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.186857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3212  hypothetical protein  38.59 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1351  hypothetical protein  38.59 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.114694  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0243  hypothetical protein  38.59 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.857236  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0604  hypothetical protein  38.59 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0440  hypothetical protein  38.59 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.334931  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0199  hypothetical protein  33.51 
 
 		 247 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0394  hypothetical protein  40.12 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.672382  decreased coverage  0.00485022 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0421  hypothetical protein  37.63 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0748675  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3888  hypothetical protein  35.35 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.835843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0485  hypothetical protein  38.36 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4933  hypothetical protein  33.49 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3161  hypothetical protein  32.51 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0263  hypothetical protein  48 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1690  conserved hypothetical membrane associated protein  40.59 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2959  hypothetical protein  53.42 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2822  hypothetical protein  53.42 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.389795 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6253  hypothetical protein  37.42 
 
 		 252 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0305  hypothetical protein  30.05 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0621  hypothetical protein  31.75 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3357  hypothetical protein  43.24 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2925  hypothetical protein  58.33 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2910  hypothetical protein  58.33 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294767  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2296  hypothetical protein  58.33 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4509  hypothetical protein  41.12 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0449  hypothetical protein  31.47 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0526  hypothetical protein  43.02 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  hitchhiker  0.00000832605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0749  hypothetical protein  40 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3635  hypothetical protein  36.47 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00166096  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3262  hypothetical protein  39.29 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.340682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>