19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1227 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1227  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.80625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4021  hypothetical protein  56.1 
 
 		 207 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.101508  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1412  hypothetical protein  49.78 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0095  hypothetical protein  56.72 
 
 		 113 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0681  hypothetical protein  56.72 
 
 		 130 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0122  hypothetical protein  55.38 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4381  hypothetical protein  50.75 
 
 		 128 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3747  hypothetical protein  47.76 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1725  hypothetical protein  47.76 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1548  hypothetical protein  49.25 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00845289  normal  0.074415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2928  hypothetical protein  49.43 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2802  hypothetical protein  57.35 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2931  hypothetical protein  46.97 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2541  hypothetical protein  47.69 
 
 		 110 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2817  hypothetical protein  46.15 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  34.15 
 
 		 303 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  32.93 
 
 		 297 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  33.85 
 
 		 344 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  36.47 
 
 		 288 aa  41.6  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>