20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1725 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1725  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3747  hypothetical protein  85.83 
 
 		 120 aa  169  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4381  hypothetical protein  68.03 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0095  hypothetical protein  45.83 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1548  hypothetical protein  57.98 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00845289  normal  0.074415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0681  hypothetical protein  45 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0122  hypothetical protein  63.64 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2802  hypothetical protein  43.96 
 
 		 110 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2931  hypothetical protein  42.98 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1227  hypothetical protein  47.76 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.80625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1412  hypothetical protein  50 
 
 		 211 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2541  hypothetical protein  47.69 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2928  hypothetical protein  46.15 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2817  hypothetical protein  47.69 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  39.42 
 
 		 283 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  38.46 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  37.5 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4021  hypothetical protein  48.98 
 
 		 207 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.101508  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  36.97 
 
 		 288 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  35.4 
 
 		 344 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>