20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2802 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2802  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  213  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0681  hypothetical protein  40.19 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2541  hypothetical protein  46.59 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4381  hypothetical protein  48.61 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348252  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1725  hypothetical protein  38.54 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0095  hypothetical protein  40.54 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3747  hypothetical protein  35.42 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0122  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2928  hypothetical protein  44.59 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1227  hypothetical protein  57.35 
 
 		 222 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.80625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2931  hypothetical protein  33.96 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1412  hypothetical protein  53.03 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1548  hypothetical protein  42.65 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00845289  normal  0.074415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2817  hypothetical protein  41.79 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  40.4 
 
 		 283 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4021  hypothetical protein  44.9 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.101508  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  33.33 
 
 		 344 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  30.77 
 
 		 303 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  42.03 
 
 		 288 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  30.1 
 
 		 297 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>