16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0095 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0095  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0681  hypothetical protein  79.65 
 
 		 130 aa  180  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0122  hypothetical protein  75.23 
 
 		 109 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4381  hypothetical protein  61.11 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2931  hypothetical protein  47.83 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1548  hypothetical protein  67.65 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00845289  normal  0.074415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1725  hypothetical protein  61.76 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3747  hypothetical protein  45.9 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1227  hypothetical protein  56.72 
 
 		 222 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.80625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2928  hypothetical protein  47.67 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2802  hypothetical protein  40.54 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2541  hypothetical protein  49.3 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2817  hypothetical protein  49.28 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1412  hypothetical protein  50.77 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4021  hypothetical protein  52.08 
 
 		 207 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.101508  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  35.38 
 
 		 344 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>