20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3747 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3747  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  234  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1725  hypothetical protein  85.83 
 
 		 119 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4381  hypothetical protein  65.04 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0095  hypothetical protein  49.18 
 
 		 113 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0681  hypothetical protein  46.34 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1548  hypothetical protein  59.17 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00845289  normal  0.074415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2802  hypothetical protein  41.57 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0122  hypothetical protein  57.58 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2931  hypothetical protein  41.8 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1227  hypothetical protein  47.76 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.80625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2541  hypothetical protein  50.75 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2928  hypothetical protein  48.57 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1412  hypothetical protein  42.42 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2817  hypothetical protein  44.78 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  38.1 
 
 		 283 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  36 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  35 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4021  hypothetical protein  48.15 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.101508  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  34.45 
 
 		 288 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  35.19 
 
 		 344 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>