59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1221 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4657    97.24 
 
 
663 bp  950    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1221    100 
 
 
1029 bp  2040    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3996  ISPsy5, transposase  81.39 
 
 
1554 bp  472  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3613  ISPsy5, transposase  81.39 
 
 
1554 bp  472  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4764  ISPsy5, transposase  81.39 
 
 
1554 bp  472  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  81.05 
 
 
1521 bp  468  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  81.05 
 
 
1521 bp  468  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  81.05 
 
 
1521 bp  468  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4994  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4737  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3999  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00912569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4251  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4389  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4567  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4693  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5591  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5212  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5215  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5304  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5368  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5411  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5443  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5445  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5543  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0035  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0039  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0196  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.904246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0670  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1020  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1098  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1189  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1227  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2437  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2460  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2840  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0352443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2971  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3213  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3216  ISPsy5, transposase  81.29 
 
 
1554 bp  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.727249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  83.1 
 
 
1533 bp  394  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  83.1 
 
 
1533 bp  394  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  83.1 
 
 
1533 bp  394  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  82.94 
 
 
1533 bp  387  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  81.2 
 
 
1533 bp  204  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  81.2 
 
 
1533 bp  204  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  79.17 
 
 
1512 bp  143  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4791  ISPsy5, transposase  86.21 
 
 
156 bp  103  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0160  transposase IS66  86.41 
 
 
1569 bp  93.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328115  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0431  transposase IS66  86.41 
 
 
1563 bp  93.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0434  transposase IS66  86.41 
 
 
1563 bp  93.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.543739  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1050  transposase IS66  86.41 
 
 
1563 bp  93.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1163  transposase IS66  86.41 
 
 
1563 bp  93.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230902  normal  0.467895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1548  transposase IS66  86.41 
 
 
1563 bp  93.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.446339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1988  transposase IS66  86.41 
 
 
1563 bp  93.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3084  transposase IS66  86.41 
 
 
1563 bp  93.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3638  transposase IS66  86.41 
 
 
1563 bp  93.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4114  transposase IS66  86.41 
 
 
1563 bp  93.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0036  transposase IS66  86.41 
 
 
1575 bp  93.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0035    86.41 
 
 
2622 bp  93.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
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