55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0539 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0539  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  443  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154515  unclonable  0.00000000103423 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2016  hypothetical protein  62.71 
 
 		 238 aa  281  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1734  hypothetical protein  52.42 
 
 		 182 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2062  hypothetical protein  43.02 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0555  hypothetical protein  35.87 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3060  hypothetical protein  29.69 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4857  hypothetical protein  30.14 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0246894 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0562  hypothetical protein  34.78 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0601987  normal  0.0329184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3855  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4227  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0478  protein of unknown function DUF937  33.7 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256572  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0267  hypothetical protein  34.78 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7531  hypothetical protein  34.48 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0005  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4207  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3910  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0511  hypothetical protein  34.48 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03525  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.998118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5147  hypothetical protein  28.95 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.670787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1730  protein of unknown function DUF937  29.13 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.6083 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03581  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0005  protein of unknown function DUF937  32.56 
 
 		 132 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2429  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1814  protein of unknown function DUF937  29.17 
 
 		 142 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4063  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5126  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.20781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2373  hypothetical protein  29.17 
 
 		 142 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117138  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3772  protein of unknown function DUF937  31.37 
 
 		 133 aa  52.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7138  protein of unknown function DUF937  30.86 
 
 		 143 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00491269  normal  0.388289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3664  protein of unknown function DUF937  29.41 
 
 		 133 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0283759  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6233  hypothetical protein  31.91 
 
 		 143 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1870  hypothetical protein  29.31 
 
 		 142 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.951704  hitchhiker  0.000304239 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1846  hypothetical protein  31.91 
 
 		 143 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1427  hypothetical protein  29.31 
 
 		 143 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.874769  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2683  protein of unknown function DUF937  32.1 
 
 		 116 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3368  protein of unknown function DUF937  32.05 
 
 		 119 aa  48.5  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14975  hypothetical protein  34.29 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.259264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0939  hypothetical protein  28.97 
 
 		 147 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933018  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1319  hypothetical protein  30 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1756  hypothetical protein  30.85 
 
 		 143 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0455  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1784  hypothetical protein  30.85 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1654  hypothetical protein  29.17 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469031  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2764  hypothetical protein  39.73 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.465593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1884  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7942  protein of unknown function DUF937  32.5 
 
 		 157 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1214  hypothetical protein  31.25 
 
 		 157 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2206  hypothetical protein  31.18 
 
 		 140 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0738  hypothetical protein  30.67 
 
 		 150 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1866  hypothetical protein  31.18 
 
 		 140 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0031  hypothetical protein  31.18 
 
 		 140 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.48544  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1137  hypothetical protein  31.18 
 
 		 140 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1376  hypothetical protein  31.18 
 
 		 140 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.40321  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0305  protein of unknown function DUF937  31.25 
 
 		 157 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2166  protein of unknown function DUF937  28 
 
 		 146 aa  42.4  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>