40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2016 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2016  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  470  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1734  hypothetical protein  73.11 
 
 		 182 aa  317  7.999999999999999e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0539  hypothetical protein  60.59 
 
 		 229 aa  246  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154515  unclonable  0.00000000103423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2062  hypothetical protein  37.08 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3855  hypothetical protein  29.55 
 
 		 136 aa  52.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0555  hypothetical protein  33.7 
 
 		 192 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14975  hypothetical protein  32.91 
 
 		 195 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.259264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7531  hypothetical protein  34.48 
 
 		 198 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1319  hypothetical protein  32.91 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4857  hypothetical protein  28.68 
 
 		 161 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0246894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2429  hypothetical protein  29.58 
 
 		 138 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3060  hypothetical protein  27.2 
 
 		 129 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2271  hypothetical protein  28.43 
 
 		 113 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0577348  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1730  protein of unknown function DUF937  28.28 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0562  hypothetical protein  31.52 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0601987  normal  0.0329184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0455  hypothetical protein  32.18 
 
 		 192 aa  49.3  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0267  hypothetical protein  32.61 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0478  protein of unknown function DUF937  31.52 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1814  protein of unknown function DUF937  29.6 
 
 		 142 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147031 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0939  hypothetical protein  31.67 
 
 		 147 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933018  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2373  hypothetical protein  29.6 
 
 		 142 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117138  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5147  hypothetical protein  25.83 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.670787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1427  hypothetical protein  28.93 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.874769  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6233  hypothetical protein  29.17 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1846  hypothetical protein  29.17 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1870  hypothetical protein  27.78 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.951704  hitchhiker  0.000304239 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3772  protein of unknown function DUF937  28.57 
 
 		 133 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1866  hypothetical protein  31.15 
 
 		 140 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1137  hypothetical protein  31.15 
 
 		 140 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0031  hypothetical protein  31.15 
 
 		 140 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.48544  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1376  hypothetical protein  31.15 
 
 		 140 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.40321  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4207  hypothetical protein  24.24 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3910  hypothetical protein  24.24 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0005  hypothetical protein  24.24 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03581  hypothetical protein  24.24 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03525  hypothetical protein  24.24 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.998118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0005  protein of unknown function DUF937  24.24 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2528  hypothetical protein  31.58 
 
 		 131 aa  42.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2764  hypothetical protein  38.03 
 
 		 187 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.465593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>