31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1582 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1582  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  629  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1176  hypothetical protein  64.21 
 
 
312 aa  401  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1022  hypothetical protein  59.41 
 
 
330 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1296  hypothetical protein  55.81 
 
 
317 aa  359  3e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.335691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1205  hypothetical protein  46.92 
 
 
312 aa  292  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2176  Domain of unknown function DUF1848  48.03 
 
 
317 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00188552  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1199  hypothetical protein  51.81 
 
 
277 aa  280  3e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2651  hypothetical protein  41.39 
 
 
360 aa  266  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1906  hypothetical protein  42.52 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000265921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0018  hypothetical protein  43.07 
 
 
301 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0347  hypothetical protein  41.41 
 
 
322 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011083  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1427  hypothetical protein  42.44 
 
 
318 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.814658  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1816  Domain of unknown function DUF1848  39.06 
 
 
297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000935174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3587  hypothetical protein  38.46 
 
 
311 aa  216  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0293  hypothetical protein  39.2 
 
 
309 aa  216  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1315  hypothetical protein  38.89 
 
 
304 aa  209  5e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22330  protein of unknown function (DUF1848)  37.91 
 
 
322 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000024887  normal  0.601737 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1875  hypothetical protein  40 
 
 
293 aa  203  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2841  hypothetical protein  39.93 
 
 
280 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.114841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2807  protein of unknown function DUF1848  38.91 
 
 
305 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2328  Domain of unknown function DUF1848  36.86 
 
 
314 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3557  hypothetical protein  38.35 
 
 
301 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1123  hypothetical protein  38.71 
 
 
278 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1483  hypothetical protein  34.65 
 
 
342 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0329  hypothetical protein  36.92 
 
 
278 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2240  hypothetical protein  34.74 
 
 
321 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4116  domain of unknown function DUF1848  33.46 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.174931  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0457  hypothetical protein  34.15 
 
 
335 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2978  hypothetical protein  33.69 
 
 
323 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1422  hypothetical protein  30.11 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  41.27 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>