30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3587 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3587  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  652    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1315  hypothetical protein  69.54 
 
 
304 aa  452  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22330  protein of unknown function (DUF1848)  60.93 
 
 
322 aa  404  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000024887  normal  0.601737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2328  Domain of unknown function DUF1848  59.61 
 
 
314 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0293  hypothetical protein  40.47 
 
 
309 aa  245  8e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1176  hypothetical protein  39.26 
 
 
312 aa  227  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1205  hypothetical protein  39.6 
 
 
312 aa  222  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1582  hypothetical protein  38.46 
 
 
304 aa  216  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2176  Domain of unknown function DUF1848  36.63 
 
 
317 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00188552  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1296  hypothetical protein  37.97 
 
 
317 aa  215  7e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.335691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1022  hypothetical protein  35.65 
 
 
330 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0018  hypothetical protein  34.88 
 
 
301 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2651  hypothetical protein  33.99 
 
 
360 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1906  hypothetical protein  34.23 
 
 
306 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000265921  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1427  hypothetical protein  33.55 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.814658  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1816  Domain of unknown function DUF1848  34.39 
 
 
297 aa  172  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000935174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1875  hypothetical protein  32.62 
 
 
293 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1199  hypothetical protein  32.73 
 
 
277 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0347  hypothetical protein  30.23 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2807  protein of unknown function DUF1848  30.56 
 
 
305 aa  159  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2240  hypothetical protein  30.51 
 
 
321 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0457  hypothetical protein  33.67 
 
 
335 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2841  hypothetical protein  30.69 
 
 
280 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.114841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4116  domain of unknown function DUF1848  28.94 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.174931  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3557  hypothetical protein  26.06 
 
 
301 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1123  hypothetical protein  30.22 
 
 
278 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1483  hypothetical protein  26.44 
 
 
342 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0329  hypothetical protein  28.52 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2978  hypothetical protein  25.27 
 
 
323 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1422  hypothetical protein  23.79 
 
 
274 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>