30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1176 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1176  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  645    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1582  hypothetical protein  64.21 
 
 		 304 aa  401  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1022  hypothetical protein  58.03 
 
 		 330 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1296  hypothetical protein  53.77 
 
 		 317 aa  361  8e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.335691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1205  hypothetical protein  48.82 
 
 		 312 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2176  Domain of unknown function DUF1848  47.8 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00188552  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1199  hypothetical protein  50 
 
 		 277 aa  270  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2651  hypothetical protein  42.81 
 
 		 360 aa  263  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0018  hypothetical protein  42.47 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1906  hypothetical protein  42.33 
 
 		 306 aa  235  8e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000265921  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3587  hypothetical protein  39.26 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1816  Domain of unknown function DUF1848  39.32 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000935174  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1427  hypothetical protein  42.86 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.814658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0347  hypothetical protein  40.54 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011083  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1315  hypothetical protein  39 
 
 		 304 aa  215  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0293  hypothetical protein  39.93 
 
 		 309 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22330  protein of unknown function (DUF1848)  39.06 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000024887  normal  0.601737 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1875  hypothetical protein  41.76 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2328  Domain of unknown function DUF1848  39.8 
 
 		 314 aa  202  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2841  hypothetical protein  39.48 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.114841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2807  protein of unknown function DUF1848  37.41 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1483  hypothetical protein  36.42 
 
 		 342 aa  186  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3557  hypothetical protein  37.01 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4116  domain of unknown function DUF1848  33.21 
 
 		 269 aa  179  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.174931  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0457  hypothetical protein  36.97 
 
 		 335 aa  178  9e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2240  hypothetical protein  38.04 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1123  hypothetical protein  36.52 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0329  hypothetical protein  33.69 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2978  hypothetical protein  34.59 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1422  hypothetical protein  28.26 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>