30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1123 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1123  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0329  hypothetical protein  83.81 
 
 
278 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1582  hypothetical protein  38.71 
 
 
304 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2978  hypothetical protein  33.92 
 
 
323 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1205  hypothetical protein  34.55 
 
 
312 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2651  hypothetical protein  33.57 
 
 
360 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2176  Domain of unknown function DUF1848  33.81 
 
 
317 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00188552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1906  hypothetical protein  33.7 
 
 
306 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000265921  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1875  hypothetical protein  33.81 
 
 
293 aa  159  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1022  hypothetical protein  34.4 
 
 
330 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0347  hypothetical protein  32.99 
 
 
322 aa  156  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011083  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1176  hypothetical protein  36.52 
 
 
312 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1296  hypothetical protein  35.54 
 
 
317 aa  154  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.335691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0018  hypothetical protein  35.25 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4116  domain of unknown function DUF1848  34.05 
 
 
269 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.174931  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3557  hypothetical protein  31.65 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2841  hypothetical protein  31.47 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.114841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2807  protein of unknown function DUF1848  30.9 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2240  hypothetical protein  30.07 
 
 
321 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1199  hypothetical protein  29.86 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22330  protein of unknown function (DUF1848)  30.07 
 
 
322 aa  132  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000024887  normal  0.601737 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1816  Domain of unknown function DUF1848  30.69 
 
 
297 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000935174  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1427  hypothetical protein  30.22 
 
 
318 aa  128  9.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.814658  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3587  hypothetical protein  30.22 
 
 
311 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1483  hypothetical protein  28.52 
 
 
342 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0457  hypothetical protein  31.93 
 
 
335 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1422  hypothetical protein  31.49 
 
 
274 aa  122  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1315  hypothetical protein  29.6 
 
 
304 aa  122  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2328  Domain of unknown function DUF1848  29.86 
 
 
314 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0293  hypothetical protein  29.86 
 
 
309 aa  119  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>