30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3557 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3557  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  599  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1582  hypothetical protein  38.35 
 
 
304 aa  189  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1296  hypothetical protein  35.19 
 
 
317 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.335691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2176  Domain of unknown function DUF1848  36.81 
 
 
317 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00188552  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1176  hypothetical protein  37.01 
 
 
312 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2240  hypothetical protein  38.65 
 
 
321 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1022  hypothetical protein  33.45 
 
 
330 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1205  hypothetical protein  29.58 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1906  hypothetical protein  34.05 
 
 
306 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000265921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2807  protein of unknown function DUF1848  33.56 
 
 
305 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0018  hypothetical protein  32.98 
 
 
301 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2841  hypothetical protein  37.73 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.114841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2651  hypothetical protein  31.62 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1816  Domain of unknown function DUF1848  30.11 
 
 
297 aa  161  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000935174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0347  hypothetical protein  33.22 
 
 
322 aa  159  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4116  domain of unknown function DUF1848  30.55 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.174931  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1875  hypothetical protein  35.54 
 
 
293 aa  152  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1199  hypothetical protein  34.98 
 
 
277 aa  149  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0329  hypothetical protein  30.94 
 
 
278 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1123  hypothetical protein  31.65 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2978  hypothetical protein  32.38 
 
 
323 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1315  hypothetical protein  28.67 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1483  hypothetical protein  31.46 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0293  hypothetical protein  30.58 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22330  protein of unknown function (DUF1848)  29.49 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000024887  normal  0.601737 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0457  hypothetical protein  26.94 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3587  hypothetical protein  26.06 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1427  hypothetical protein  36.4 
 
 
318 aa  126  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.814658  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2328  Domain of unknown function DUF1848  28.97 
 
 
314 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1422  hypothetical protein  27.57 
 
 
274 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>