30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0347 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0347  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2176  Domain of unknown function DUF1848  43.38 
 
 
317 aa  269  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00188552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2651  hypothetical protein  39.44 
 
 
360 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2807  protein of unknown function DUF1848  43.28 
 
 
305 aa  254  9e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0018  hypothetical protein  40.94 
 
 
301 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1205  hypothetical protein  40.32 
 
 
312 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1022  hypothetical protein  38.78 
 
 
330 aa  238  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1582  hypothetical protein  41.41 
 
 
304 aa  236  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1906  hypothetical protein  40.8 
 
 
306 aa  236  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000265921  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1296  hypothetical protein  38.96 
 
 
317 aa  226  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.335691  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1176  hypothetical protein  40.54 
 
 
312 aa  219  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1199  hypothetical protein  41.61 
 
 
277 aa  216  5e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1875  hypothetical protein  39.24 
 
 
293 aa  206  5e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2841  hypothetical protein  38.55 
 
 
280 aa  205  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.114841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2240  hypothetical protein  37.46 
 
 
321 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1816  Domain of unknown function DUF1848  32.89 
 
 
297 aa  193  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000935174  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1483  hypothetical protein  35.76 
 
 
342 aa  192  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0293  hypothetical protein  36.12 
 
 
309 aa  187  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0457  hypothetical protein  35.26 
 
 
335 aa  176  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22330  protein of unknown function (DUF1848)  32.12 
 
 
322 aa  176  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000024887  normal  0.601737 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1427  hypothetical protein  32.82 
 
 
318 aa  172  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.814658  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4116  domain of unknown function DUF1848  32.36 
 
 
269 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.174931  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1315  hypothetical protein  30.64 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3587  hypothetical protein  30.23 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2328  Domain of unknown function DUF1848  31.77 
 
 
314 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3557  hypothetical protein  34.05 
 
 
301 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1123  hypothetical protein  32.99 
 
 
278 aa  156  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2978  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0329  hypothetical protein  31.62 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1422  hypothetical protein  29.89 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>