30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1022 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1022  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  690    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1582  hypothetical protein  59.41 
 
 
304 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1176  hypothetical protein  58.03 
 
 
312 aa  373  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1296  hypothetical protein  50.32 
 
 
317 aa  348  8e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.335691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1205  hypothetical protein  45.06 
 
 
312 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1199  hypothetical protein  49.64 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2176  Domain of unknown function DUF1848  45.83 
 
 
317 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00188552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2651  hypothetical protein  43.33 
 
 
360 aa  259  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0018  hypothetical protein  41.88 
 
 
301 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1906  hypothetical protein  42 
 
 
306 aa  245  9e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000265921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0347  hypothetical protein  38.78 
 
 
322 aa  238  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011083  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1816  Domain of unknown function DUF1848  40.48 
 
 
297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000935174  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0293  hypothetical protein  39.74 
 
 
309 aa  223  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1427  hypothetical protein  37.99 
 
 
318 aa  215  8e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.814658  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22330  protein of unknown function (DUF1848)  36.84 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000024887  normal  0.601737 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3587  hypothetical protein  35.65 
 
 
311 aa  210  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1315  hypothetical protein  37.12 
 
 
304 aa  207  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2841  hypothetical protein  38.01 
 
 
280 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.114841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2807  protein of unknown function DUF1848  35.93 
 
 
305 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2240  hypothetical protein  36.59 
 
 
321 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1875  hypothetical protein  36.2 
 
 
293 aa  187  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2328  Domain of unknown function DUF1848  33.78 
 
 
314 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3557  hypothetical protein  34.07 
 
 
301 aa  175  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4116  domain of unknown function DUF1848  31.73 
 
 
269 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.174931  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1483  hypothetical protein  32.43 
 
 
342 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0457  hypothetical protein  32.57 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1123  hypothetical protein  34.4 
 
 
278 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2978  hypothetical protein  33.22 
 
 
323 aa  152  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0329  hypothetical protein  32.37 
 
 
278 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1422  hypothetical protein  27.44 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>