30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1296 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1296  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  664    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.335691  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1176  hypothetical protein  53.77 
 
 
312 aa  361  8e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1582  hypothetical protein  55.81 
 
 
304 aa  359  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1022  hypothetical protein  50.32 
 
 
330 aa  348  7e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1205  hypothetical protein  48.15 
 
 
312 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1199  hypothetical protein  47.83 
 
 
277 aa  282  5.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2176  Domain of unknown function DUF1848  44.97 
 
 
317 aa  279  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00188552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1906  hypothetical protein  44.7 
 
 
306 aa  256  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000265921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0018  hypothetical protein  42.76 
 
 
301 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2651  hypothetical protein  37.46 
 
 
360 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0347  hypothetical protein  38.96 
 
 
322 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011083  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22330  protein of unknown function (DUF1848)  37.7 
 
 
322 aa  224  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000024887  normal  0.601737 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1816  Domain of unknown function DUF1848  41.11 
 
 
297 aa  224  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000935174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3587  hypothetical protein  37.97 
 
 
311 aa  215  8e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2841  hypothetical protein  40.22 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.114841  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1875  hypothetical protein  39.51 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1315  hypothetical protein  38.38 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2807  protein of unknown function DUF1848  38.01 
 
 
305 aa  209  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0293  hypothetical protein  37.67 
 
 
309 aa  208  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0457  hypothetical protein  36.86 
 
 
335 aa  202  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1427  hypothetical protein  36.07 
 
 
318 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.814658  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3557  hypothetical protein  35.61 
 
 
301 aa  186  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2328  Domain of unknown function DUF1848  34.71 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4116  domain of unknown function DUF1848  33.58 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.174931  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2240  hypothetical protein  34.42 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1483  hypothetical protein  35.44 
 
 
342 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2978  hypothetical protein  36.07 
 
 
323 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1123  hypothetical protein  35.54 
 
 
278 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0329  hypothetical protein  32.97 
 
 
278 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1422  hypothetical protein  26.55 
 
 
274 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>