17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1372 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1372  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.515412  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2086  hypothetical protein  60.39 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2485  hypothetical protein  55.35 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4705  hypothetical protein  52.15 
 
 		 287 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731007  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4845  hypothetical protein  57.14 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.754626  normal  0.106217 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6680  hypothetical protein  52.63 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0582  hypothetical protein  67.97 
 
 		 194 aa  187  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5558  hypothetical protein  45.45 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6673  hypothetical protein  46.89 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6119  hypothetical protein  31.47 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.620805  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1867  hypothetical protein  31.34 
 
 		 267 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.715843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5305  hypothetical protein  32.5 
 
 		 258 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2308  hypothetical protein  32.5 
 
 		 258 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2757  hypothetical protein  31.16 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3416  hypothetical protein  25.63 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2642  hypothetical protein  24.35 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.52745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0583  hypothetical protein  69.23 
 
 		 30 aa  43.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>