15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3416 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3416  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16382  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1867  hypothetical protein  28.81 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.715843  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2757  hypothetical protein  30.51 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4845  hypothetical protein  28.33 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.754626  normal  0.106217 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6680  hypothetical protein  25.85 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6119  hypothetical protein  27.84 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.620805  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1372  hypothetical protein  25.63 
 
 
223 aa  79  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.515412  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2086  hypothetical protein  32.35 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51673  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5305  hypothetical protein  25 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452589  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2308  hypothetical protein  25 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4705  hypothetical protein  26.5 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6673  hypothetical protein  31.18 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2485  hypothetical protein  23.58 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5558  hypothetical protein  25 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2642  hypothetical protein  26.61 
 
 
278 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.52745  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>