13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2642 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2642  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  545  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.52745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5305  hypothetical protein  26.89 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2308  hypothetical protein  26.89 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1372  hypothetical protein  25.98 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.515412  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1867  hypothetical protein  27.34 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.715843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3416  hypothetical protein  27.2 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2757  hypothetical protein  25.96 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2485  hypothetical protein  28.15 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6119  hypothetical protein  27.86 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.620805  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5558  hypothetical protein  26.8 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6680  hypothetical protein  30.65 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6673  hypothetical protein  31.03 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4705  hypothetical protein  24.63 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>