16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6680 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6680  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2086  hypothetical protein  58.82 
 
 
255 aa  291  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51673  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4845  hypothetical protein  52.76 
 
 
261 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.754626  normal  0.106217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2485  hypothetical protein  51.98 
 
 
257 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4705  hypothetical protein  46.75 
 
 
287 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731007  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5558  hypothetical protein  50.4 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1372  hypothetical protein  52.63 
 
 
223 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.515412  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6673  hypothetical protein  50.79 
 
 
254 aa  228  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0582  hypothetical protein  50.96 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2757  hypothetical protein  29.81 
 
 
254 aa  89  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5305  hypothetical protein  26.05 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452589  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2308  hypothetical protein  26.05 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1867  hypothetical protein  29.3 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.715843  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6119  hypothetical protein  30.46 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.620805  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3416  hypothetical protein  25.85 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16382  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2642  hypothetical protein  26.06 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.52745  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>