17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4845 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4845  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.754626  normal  0.106217 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6680  hypothetical protein  52.76 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2086  hypothetical protein  54.55 
 
 		 255 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5558  hypothetical protein  55.56 
 
 		 256 aa  275  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2485  hypothetical protein  50 
 
 		 257 aa  249  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6673  hypothetical protein  53.94 
 
 		 254 aa  248  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1372  hypothetical protein  57.14 
 
 		 223 aa  245  6.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.515412  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4705  hypothetical protein  48.58 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731007  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0582  hypothetical protein  46.55 
 
 		 194 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6119  hypothetical protein  31.47 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.620805  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2757  hypothetical protein  33.65 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2308  hypothetical protein  28.5 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5305  hypothetical protein  28.5 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3416  hypothetical protein  28.45 
 
 		 268 aa  89.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1867  hypothetical protein  29.41 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.715843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  26 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  25.6 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>