50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1196 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1196  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0884175 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0660  lysine exporter protein LysE/YggA  63.24 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2176  leucine export protein LeuE  44.93 
 
 		 227 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2005  leucine export protein LeuE  45.9 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4188  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.54 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.0417151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  45.9 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  40.58 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3114  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.54 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  44.26 
 
 		 224 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1324  leucine export protein LeuE  44.93 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  49.02 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1180  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1018  lysine exporter protein  42.62 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  0.285378 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  48.08 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 216 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  42.62 
 
 		 216 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1914  leucine export protein LeuE  59.46 
 
 		 216 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3181  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.34 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170342  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  37.7 
 
 		 222 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1371  leucine export protein LeuE  37.7 
 
 		 222 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655348  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  32.79 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  32.79 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  32.79 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  32.79 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  32.79 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  34.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  34.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  34.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  34.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  34.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  34.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  34.43 
 
 		 212 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  32.79 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.49 
 
 		 218 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>