27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3271 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3271  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.975235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4456  hypothetical protein  65.98 
 
 		 196 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0998  hypothetical protein  64.43 
 
 		 196 aa  264  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0895  hypothetical protein  65.46 
 
 		 196 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0934  hypothetical protein  65.46 
 
 		 196 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1821  hypothetical protein  64.06 
 
 		 203 aa  256  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1493  hypothetical protein  60.85 
 
 		 200 aa  234  6e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000416932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3132  hypothetical protein  52.31 
 
 		 196 aa  217  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5511  hypothetical protein  57.73 
 
 		 200 aa  215  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3006  hypothetical protein  54.12 
 
 		 199 aa  211  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680185  normal  0.10643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3342  hypothetical protein  54.26 
 
 		 200 aa  208  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5422  hypothetical protein  51.6 
 
 		 207 aa  197  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2138  GCN5-related N-acetyltransferase  49.74 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1669  hypothetical protein  52.58 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.7266  normal  0.851284 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3559  hypothetical protein  48.44 
 
 		 195 aa  181  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2129  hypothetical protein  49.21 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0597  hypothetical protein  46.91 
 
 		 195 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2280  hypothetical protein  46.91 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0628  hypothetical protein  46.91 
 
 		 195 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0042  hypothetical protein  51.18 
 
 		 173 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0498  GCN5-related N-acetyltransferase  41.15 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1043  hypothetical protein  48.19 
 
 		 195 aa  161  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.529374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04824  hypothetical protein  48.3 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2874  hypothetical protein  45.83 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 		 189 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2414  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0241  GCN5-related N-acetyltransferase  36.13 
 
 		 197 aa  135  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>