27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04824 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04824  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  373  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0042  hypothetical protein  60 
 
 
173 aa  204  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3342  hypothetical protein  48.62 
 
 
200 aa  180  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0926102  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1493  hypothetical protein  49.43 
 
 
200 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000416932  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5511  hypothetical protein  52.27 
 
 
200 aa  175  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3559  hypothetical protein  53.41 
 
 
195 aa  170  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0998  hypothetical protein  49.15 
 
 
196 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000489848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0895  hypothetical protein  50.28 
 
 
196 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416134  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0934  hypothetical protein  50.28 
 
 
196 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4456  hypothetical protein  49.72 
 
 
196 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147792 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0628  hypothetical protein  51.14 
 
 
195 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2280  hypothetical protein  51.7 
 
 
195 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2138  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0597  hypothetical protein  50.57 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3271  hypothetical protein  48.3 
 
 
196 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.975235  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5422  hypothetical protein  44.13 
 
 
207 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3132  hypothetical protein  44.94 
 
 
196 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829638  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2129  hypothetical protein  51.14 
 
 
193 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3006  hypothetical protein  47.73 
 
 
199 aa  158  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680185  normal  0.10643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1821  hypothetical protein  46.59 
 
 
203 aa  156  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1043  hypothetical protein  55.83 
 
 
195 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.529374  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1669  hypothetical protein  48.86 
 
 
193 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.7266  normal  0.851284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2874  hypothetical protein  47.16 
 
 
191 aa  149  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228193  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0498  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
201 aa  134  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2414  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 
189 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0241  GCN5-related N-acetyltransferase  30.29 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>