27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4456 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4456  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0895  hypothetical protein  95.92 
 
 		 196 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0934  hypothetical protein  96.43 
 
 		 196 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0998  hypothetical protein  91.84 
 
 		 196 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3271  hypothetical protein  65.98 
 
 		 196 aa  265  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.975235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1821  hypothetical protein  54.69 
 
 		 203 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1493  hypothetical protein  53.09 
 
 		 200 aa  213  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000416932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2138  GCN5-related N-acetyltransferase  52.58 
 
 		 197 aa  204  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3006  hypothetical protein  49.48 
 
 		 199 aa  196  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680185  normal  0.10643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3132  hypothetical protein  47.94 
 
 		 196 aa  195  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5422  hypothetical protein  49.74 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5511  hypothetical protein  50 
 
 		 200 aa  191  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3342  hypothetical protein  49.2 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2129  hypothetical protein  45.88 
 
 		 193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1669  hypothetical protein  45.88 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.7266  normal  0.851284 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04824  hypothetical protein  49.72 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3559  hypothetical protein  45.36 
 
 		 195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0042  hypothetical protein  47.65 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0628  hypothetical protein  42.78 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0597  hypothetical protein  42.27 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2280  hypothetical protein  42.78 
 
 		 195 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0498  GCN5-related N-acetyltransferase  40.41 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1043  hypothetical protein  44.79 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.529374  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2874  hypothetical protein  41.75 
 
 		 191 aa  147  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  36.46 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2414  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0241  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>