27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0934 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0895  hypothetical protein  99.49 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0934  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4456  hypothetical protein  96.43 
 
 		 196 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0998  hypothetical protein  90.82 
 
 		 196 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3271  hypothetical protein  65.46 
 
 		 196 aa  263  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.975235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1821  hypothetical protein  55.21 
 
 		 203 aa  223  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1493  hypothetical protein  52.06 
 
 		 200 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000416932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2138  GCN5-related N-acetyltransferase  52.58 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5422  hypothetical protein  50.26 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3006  hypothetical protein  49.48 
 
 		 199 aa  193  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680185  normal  0.10643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5511  hypothetical protein  50 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3132  hypothetical protein  47.42 
 
 		 196 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3342  hypothetical protein  48.66 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2129  hypothetical protein  46.56 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1669  hypothetical protein  45.36 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.7266  normal  0.851284 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04824  hypothetical protein  50.28 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3559  hypothetical protein  45.36 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0042  hypothetical protein  48.24 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0628  hypothetical protein  42.27 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2280  hypothetical protein  42.27 
 
 		 195 aa  157  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0597  hypothetical protein  41.75 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0498  GCN5-related N-acetyltransferase  39.9 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2874  hypothetical protein  42.27 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 		 189 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1043  hypothetical protein  43.75 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.529374  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2414  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 		 189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0241  GCN5-related N-acetyltransferase  34.2 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>