27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0998 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0998  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000489848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4456  hypothetical protein  91.84 
 
 
196 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0895  hypothetical protein  90.31 
 
 
196 aa  366  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416134  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0934  hypothetical protein  90.82 
 
 
196 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3271  hypothetical protein  64.43 
 
 
196 aa  264  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.975235  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1821  hypothetical protein  53.12 
 
 
203 aa  217  7e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1493  hypothetical protein  51.55 
 
 
200 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000416932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2138  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5511  hypothetical protein  50.52 
 
 
200 aa  195  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3006  hypothetical protein  48.45 
 
 
199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680185  normal  0.10643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3132  hypothetical protein  46.39 
 
 
196 aa  194  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829638  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5422  hypothetical protein  48.42 
 
 
207 aa  192  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3342  hypothetical protein  48.13 
 
 
200 aa  189  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0926102  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2129  hypothetical protein  47.62 
 
 
193 aa  178  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3559  hypothetical protein  45.36 
 
 
195 aa  171  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1669  hypothetical protein  44.33 
 
 
193 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.7266  normal  0.851284 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04824  hypothetical protein  49.15 
 
 
185 aa  169  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0628  hypothetical protein  42.78 
 
 
195 aa  167  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2280  hypothetical protein  42.78 
 
 
195 aa  165  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0597  hypothetical protein  42.27 
 
 
195 aa  164  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0498  GCN5-related N-acetyltransferase  40.93 
 
 
201 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0042  hypothetical protein  45.29 
 
 
173 aa  156  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1043  hypothetical protein  43.01 
 
 
195 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.529374  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2414  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 
189 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2874  hypothetical protein  39.69 
 
 
191 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228193  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0241  GCN5-related N-acetyltransferase  35.08 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>