29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5422 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5422  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3342  hypothetical protein  64.58 
 
 
200 aa  270  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0926102  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1493  hypothetical protein  51.02 
 
 
200 aa  208  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000416932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3132  hypothetical protein  48.21 
 
 
196 aa  204  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829638  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3271  hypothetical protein  51.6 
 
 
196 aa  197  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.975235  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0895  hypothetical protein  50.26 
 
 
196 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416134  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0934  hypothetical protein  50.26 
 
 
196 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0998  hypothetical protein  48.42 
 
 
196 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000489848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4456  hypothetical protein  49.74 
 
 
196 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147792 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0628  hypothetical protein  48.97 
 
 
195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2280  hypothetical protein  48.45 
 
 
195 aa  187  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1821  hypothetical protein  44.56 
 
 
203 aa  184  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.534457  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3559  hypothetical protein  46.39 
 
 
195 aa  181  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0597  hypothetical protein  46.39 
 
 
195 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2129  hypothetical protein  48.13 
 
 
193 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3006  hypothetical protein  46.91 
 
 
199 aa  174  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680185  normal  0.10643 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1043  hypothetical protein  46.15 
 
 
195 aa  168  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.529374  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2874  hypothetical protein  44.62 
 
 
191 aa  165  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228193  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0042  hypothetical protein  49.4 
 
 
173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5511  hypothetical protein  45.21 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2138  GCN5-related N-acetyltransferase  42.05 
 
 
197 aa  161  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1669  hypothetical protein  44.09 
 
 
193 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.7266  normal  0.851284 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04824  hypothetical protein  44.13 
 
 
185 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0498  GCN5-related N-acetyltransferase  39.78 
 
 
201 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  35.11 
 
 
189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2414  GCN5-related N-acetyltransferase  35.11 
 
 
189 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0241  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
197 aa  131  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1890  acetyltransferase  46.51 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3456  acetyltransferase  46.51 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.436369  hitchhiker  6.246790000000001e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>