40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2725 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
60 aa  119  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.913707  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  66.67 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.86 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  48.89 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  43.33 
 
 
100 aa  48.1  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1023  twin arginine-targeting protein translocase  46.15 
 
 
59 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0942  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.07 
 
 
98 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.84 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  47.73 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  44.26 
 
 
60 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  48.28 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2684  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.51 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.388959  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1079  twin arginine-targeting protein translocase  43.18 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000000000641532  normal  0.697921 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1819  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.66 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.27 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.12 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.3 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0266  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  39.22 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.83 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  41.3 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0773  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.69 
 
 
68 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0133448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.74 
 
 
115 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.84 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  45.61 
 
 
59 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  44 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3420  twin arginine-targeting protein translocase  48.98 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.984089  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  42.11 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  41.3 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_002978  WD0152  mttA/Hcf106 family protein  44.23 
 
 
55 aa  40.4  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.48 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  38.71 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1896  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.3 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  47.92 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  36.92 
 
 
110 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  41.3 
 
 
78 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>