25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1920 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1920  methyltransferase type 11  100 
 
 		 176 aa  362  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657915 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0939  Methyltransferase type 12  31.4 
 
 		 232 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  30.56 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2892  methyltransferase type 12  34.58 
 
 		 311 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5454  methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 317 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  32.38 
 
 		 303 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1018  hypothetical protein  25.82 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.891153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  27.97 
 
 		 249 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  27.97 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2729  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 317 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  34.95 
 
 		 264 aa  44.7  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  27.64 
 
 		 289 aa  44.3  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  30.84 
 
 		 332 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 317 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1544  Generic methyltransferase  26.81 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.41 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  29.37 
 
 		 543 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 391 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  29.03 
 
 		 310 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3274  hypothetical protein  25.25 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30 
 
 		 303 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 317 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0448  methyltransferase type 12  27.95 
 
 		 307 aa  42.4  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00834451  normal  0.0296348 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 2490 aa  41.6  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  27.35 
 
 		 354 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>