21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1591 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1591  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  1019    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2899  hypothetical protein  24.46 
 
 		 502 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.550415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0928  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.65 
 
 		 502 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0952  hypothetical protein  25 
 
 		 502 aa  127  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1385  hypothetical protein  24.8 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0227  hypothetical protein  26.61 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0864  hypothetical protein  24.58 
 
 		 534 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4013  CRISPR-associated protein, Cse1 family  22.74 
 
 		 520 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1380  hypothetical protein  26.78 
 
 		 532 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0528526  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0594  hypothetical protein  25.43 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000341283  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2888  CRISPR-associated Cse1 family protein  22.22 
 
 		 520 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.447574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3062  CRISPR-associated Cse1 family protein  23.27 
 
 		 520 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00866  CRISPR-associated protein, Cse1 family  23.51 
 
 		 535 aa  50.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.046079  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1607  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.71 
 
 		 534 aa  50.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.982851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3137  Cse1 family CRISPR-associated protein  24.39 
 
 		 518 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.199062  normal  0.768115 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0957  hypothetical protein  25.58 
 
 		 521 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3097  crispr-associated protein, Cse1 family  22.07 
 
 		 511 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000104629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3254  crispr-associated protein, Cse1 family  24.09 
 
 		 518 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.552745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2479  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.92 
 
 		 539 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3547  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.34 
 
 		 534 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.061728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3071  crispr-associated protein, Cse1 family  23.56 
 
 		 519 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>