More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0979 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0979  D-fructose 1,6-bisphosphatase  100 
 
 
255 aa  498  1e-140  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.458865 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0449  inositol monophosphatase  73.58 
 
 
250 aa  378  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1670  inositol monophosphatase  71.49 
 
 
250 aa  360  1e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.160664  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1799  inositol monophosphatase  67.2 
 
 
251 aa  351  8e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.665571  normal  0.131344 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0514  inositol monophosphatase  38.46 
 
 
254 aa  164  9e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.323146 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2338  bifunctional inositol-1 monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  33.03 
 
 
258 aa  85.9  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0397  inositol monophosphatase  30.41 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  normal  0.933527 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0079  Inositol-phosphate phosphatase  33.33 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0224  inositol monophosphatase  28.69 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0560  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.44 
 
 
569 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2190  bifunctional inositol-1 monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  35.75 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  26.84 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0967  bifunctional inositol-1 monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  32.51 
 
 
258 aa  79  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1351  bifunctional inositol-1 monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  34.81 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0654792  normal  0.0197669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  32.84 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0416  Inositol-phosphate phosphatase  33.33 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000198572  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3185  inositol monophosphatase  28.8 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.777404  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0412  inositol-phosphate phosphatase  29.54 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0004  inositol-phosphate phosphatase  30.61 
 
 
260 aa  72  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  31.84 
 
 
272 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  31.84 
 
 
272 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3296  inositol monophosphatase  31.25 
 
 
254 aa  72  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  33 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  31.25 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2588  inositol-phosphate phosphatase  27.99 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3216  inositol-phosphate phosphatase  27.91 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0427  bifunctional inositol-1 monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  30.81 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.639797 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  27.47 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  27.47 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3316  inositol monophosphatase  30.22 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1219  Inositol-phosphate phosphatase  29.95 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0903  bifunctional inositol-1 monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  30.98 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0155494  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0661  Inositol-phosphate phosphatase  30.21 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.432346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  31.84 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  31.34 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0561  Inositol-phosphate phosphatase  30.45 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3711  Inositol-phosphate phosphatase  28.74 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0935134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  32.5 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  26.34 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  36.08 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  31.03 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  36.08 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  31.13 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  29.77 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  31.6 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1185  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.59 
 
 
566 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.303831  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0798  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  26.78 
 
 
567 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0633  D-fructose 1,6-bisphosphatase  27.92 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0478031  normal  0.599874 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  27.16 
 
 
267 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0159  inositol monophosphatase family protein  26.59 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  27.16 
 
 
267 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  27.41 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2977  inositol monophosphatase  31.7 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0268  inositol-phosphate phosphatase  27.85 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0335292 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  29.29 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27.16 
 
 
566 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.453564 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  29.65 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0394  inositol monophosphatase  30.57 
 
 
607 aa  66.2  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  35.37 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  26.91 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  27.38 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0942  inositol-1-monophosphatase  34.65 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0852  bifunctional inositol-1 monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  30.94 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000203783  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  26.34 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0088  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  27 
 
 
566 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  25.1 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  28.69 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  25.86 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0841  bifunctional inositol-1 monophosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  33.33 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  33.33 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  25.1 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1579  inositol-phosphate phosphatase  29.26 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0271512  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1636  extragenic supressor  29.26 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  25.09 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  25.09 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  26.74 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  25.09 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  25.09 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  25.09 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  25.09 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  25.09 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1545  inositol-1(or 4)-monophosphatase  34.15 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  25.09 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0543  inositol-phosphate phosphatase  28.16 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2070  inositol monophosphatase  28.5 
 
 
313 aa  65.1  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  27.76 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  27.76 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0128  inositol monophosphatase  27.14 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  26.74 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3449  inositol-phosphate phosphatase  29.36 
 
 
301 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0895511  normal  0.493047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0054  inositol monophosphatase  28.45 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.56898  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  25.09 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  26.86 
 
 
353 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  26.8 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  26.52 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  31.77 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  26.52 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  27.76 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0603  Inositol-phosphate phosphatase  26.61 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  27.76 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>