27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0931 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0931  prefoldin, beta subunit  100 
 
 
125 aa  243  9e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0831  prefoldin, beta subunit  78.4 
 
 
125 aa  206  9e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0777501 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1376  prefoldin, beta subunit  80.95 
 
 
126 aa  206  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.753867  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1942  prefoldin, beta subunit  83.33 
 
 
124 aa  193  8.000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0341  prefoldin, beta subunit  52.14 
 
 
121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1787  prefoldin, beta subunit  43.9 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.023483  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0082  prefoldin subunit beta  47.37 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0164656  hitchhiker  0.000222575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1672  prefoldin, beta subunit  37.84 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2110  prefoldin, beta subunit  33.33 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0656  prefoldin subunit beta  33.03 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.963638  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1336  hypothetical protein  33.88 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.484588  normal  0.0167667 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1357  prefoldin, beta subunit  35.16 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2288  prefoldin, beta subunit  29.73 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1258  prefoldin, beta subunit  36.45 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1247  prefoldin, beta subunit  37.65 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0708  prefoldin, beta subunit  34.55 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0213  prefoldin, subunit beta  30.63 
 
 
117 aa  53.9  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1817  prefoldin, beta subunit  33.33 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.674305 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1428  prefoldin, beta subunit  36.59 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2449  prefoldin, beta subunit  31.96 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0205  prefoldin, beta subunit  29.73 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.402799  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1486  prefoldin, beta subunit  28.87 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0567  prefoldin, beta subunit  28.85 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.707557 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1123  prefoldin, beta subunit  35.77 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00123512  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0436  prefoldin subunit beta  30.33 
 
 
129 aa  47  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000813008 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0175  prefoldin, beta subunit  30.68 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.697997  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51362  predicted protein  28.92 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.19351  normal  0.0988202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>