28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0213 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0213  prefoldin, subunit beta  100 
 
 		 117 aa  226  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0205  prefoldin, beta subunit  64.96 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.402799  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1357  prefoldin, beta subunit  54.62 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0341  prefoldin, beta subunit  35.4 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0567  prefoldin, beta subunit  36.61 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.707557 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1672  prefoldin, beta subunit  44.44 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1376  prefoldin, beta subunit  35.14 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.753867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1942  prefoldin, beta subunit  32.43 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2288  prefoldin, beta subunit  42.34 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1486  prefoldin, beta subunit  36.63 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1787  prefoldin, beta subunit  36.28 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.023483  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2110  prefoldin, beta subunit  40.74 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1336  hypothetical protein  41.18 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.484588  normal  0.0167667 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0831  prefoldin, beta subunit  32.73 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0777501 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0931  prefoldin, beta subunit  30.63 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2449  prefoldin, beta subunit  35.64 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1817  prefoldin, beta subunit  41.67 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.674305 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0008  prefoldin, beta subunit  39.29 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.465304  normal  0.352896 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0708  prefoldin, beta subunit  40.91 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1123  prefoldin, beta subunit  31.86 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00123512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1247  prefoldin, beta subunit  40.91 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1258  prefoldin, beta subunit  38.18 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2676  prefoldin, beta subunit  35.45 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1428  prefoldin, beta subunit  38.18 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0436  prefoldin subunit beta  30 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000813008 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0082  prefoldin subunit beta  33.04 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0164656  hitchhiker  0.000222575 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0175  prefoldin, beta subunit  35.78 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.697997  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0656  prefoldin subunit beta  30.1 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.963638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>