29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1672 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1672  prefoldin, beta subunit  100 
 
 		 121 aa  238  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2110  prefoldin, beta subunit  66.12 
 
 		 121 aa  150  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2288  prefoldin, beta subunit  59.66 
 
 		 120 aa  137  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1817  prefoldin, beta subunit  61.54 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.674305 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1336  hypothetical protein  48.65 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.484588  normal  0.0167667 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0931  prefoldin, beta subunit  37.84 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0341  prefoldin, beta subunit  34.82 
 
 		 121 aa  76.6  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1942  prefoldin, beta subunit  36.04 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0831  prefoldin, beta subunit  36.04 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0777501 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1376  prefoldin, beta subunit  35.29 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.753867  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1787  prefoldin, beta subunit  36.44 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.023483  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0567  prefoldin, beta subunit  33.03 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.707557 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1357  prefoldin, beta subunit  46.96 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2449  prefoldin, beta subunit  32.65 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0213  prefoldin, subunit beta  44.44 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1486  prefoldin, beta subunit  31.63 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0205  prefoldin, beta subunit  45.37 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.402799  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0708  prefoldin, beta subunit  37.96 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1123  prefoldin, beta subunit  33.93 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00123512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1247  prefoldin, beta subunit  35.71 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0082  prefoldin subunit beta  37.74 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0164656  hitchhiker  0.000222575 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1258  prefoldin, beta subunit  38.89 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1428  prefoldin, beta subunit  35.53 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0436  prefoldin subunit beta  34.48 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000813008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2676  prefoldin, beta subunit  35.56 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0008  prefoldin, beta subunit  33.94 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.465304  normal  0.352896 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0656  prefoldin subunit beta  31.07 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.963638  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0175  prefoldin, beta subunit  37.84 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.697997  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3021  prefoldin alpha subunit  29.55 
 
 		 149 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>