28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2110 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2110  prefoldin, beta subunit  100 
 
 
121 aa  236  6.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1672  prefoldin, beta subunit  66.12 
 
 
121 aa  140  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2288  prefoldin, beta subunit  61.54 
 
 
120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1817  prefoldin, beta subunit  59.5 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.674305 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1336  hypothetical protein  49.56 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.484588  normal  0.0167667 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0341  prefoldin, beta subunit  35.4 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0931  prefoldin, beta subunit  33.33 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0831  prefoldin, beta subunit  31.53 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0777501 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1376  prefoldin, beta subunit  30.77 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.753867  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1942  prefoldin, beta subunit  30.63 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1357  prefoldin, beta subunit  35.48 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1787  prefoldin, beta subunit  30.56 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.023483  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0567  prefoldin, beta subunit  32.08 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.707557 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2449  prefoldin, beta subunit  34.02 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0213  prefoldin, subunit beta  35.71 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0436  prefoldin subunit beta  37.4 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000813008 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1486  prefoldin, beta subunit  32.99 
 
 
133 aa  57.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0082  prefoldin subunit beta  32.04 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0164656  hitchhiker  0.000222575 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0205  prefoldin, beta subunit  36.14 
 
 
117 aa  53.9  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.402799  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1123  prefoldin, beta subunit  31.25 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00123512  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0708  prefoldin, beta subunit  35.63 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1247  prefoldin, beta subunit  34.48 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1258  prefoldin, beta subunit  32.95 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1428  prefoldin, beta subunit  33.33 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0008  prefoldin, beta subunit  31.48 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.465304  normal  0.352896 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0656  prefoldin subunit beta  28.16 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.963638  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0175  prefoldin, beta subunit  31.82 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.697997  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2676  prefoldin, beta subunit  32.08 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>